既に発動した「1」の効果を持つカードの上に他のカードをセットし、セットしたカードが除去された場合、既に発動した「1」の効果を再度発動することはできますか？

いいえ、できません。
場の下に移動したとしても、「「召」「1」の効果を既に発動した」という情報は残っているためです。

ただし、発動していない「召」「1」の効果があり、そのターン中にそのカードの他の「召」「1」の効果を発動してない場合は、発動することができます。